精确解剖DNA与蛋白质的相互作用对于阐明识别基础、动力学和基因调控机制至关重要。然而，弱的和动态的DNA-蛋白质相互作用的系统分析仍然是一个长期的挑战。近日，来自中国科学院上海药物研究所的Xiao-Hua Chen等人建立了光诱导赖氨酸（K）交联（LIKE-XL）策略，用于DNA-蛋白质相互作用的时空和全局分析。

文章要点：

1) 该研究利用捕捉微弱和短暂的DNA-蛋白质相互作用的独特能力，成功证实了LIKE-XL能够通过序列特异性DNA诱饵发现低亲和力转录因子/DNA相互作用，从而确定以前未知的转录因子的结合位点；

2) 此外，研究以时间分辨的方式成功地破译了转录因子亚过程对药物治疗的反应动力学，并从药物扰动中找到了下游靶转录因子，从而深入了解了它们的动态转录网络，且LIKE-XL策略提供了一种互补的方法来扩展DNA-蛋白质分析工具，并绘制之前无法通过非共价策略获得的准确的DNA-蛋白质相互作用体，以更好地了解蛋白质在健康和疾病中的功能。

参考资料：

Guo, AD., Yan, KN., Hu, H. et al. Spatiotemporal and global profiling of DNA–protein interactions enables discovery of low-affinity transcription factors. Nat. Chem. (2023).

10.1038/s41557-023-01196-z

https://doi.org/10.1038/s41557-023-01196-z