RNA脱氨酶是碱基编辑和RNA分子记录的强大工具。然而，由于RNA结构和序列依赖性，目前可用的RNA分子记录器如TRIBE、DART或STAMP中使用的酶具有局限性。鉴于此，来自加利福尼亚大学细胞与组织生物学系的Stephen N. Floor等人为RNA分子记录器的定向进化设计了一种新的平台。

文章要点：

1) 该研究设计了一种具有高活性、低偏倚和低背景的RNA A-to-I脱氨酶（一种RNA腺苷碱基编辑器，rABE），使用rABE，研究提出了REMORA（腺苷中RNA编码的分子记录），其中rABE的脱氨作用记录了RNA-蛋白质相互作用的分子记录，通过将rABE与C-to-U脱氨酶APOBEC1和长读RNA测序相结合，测量了两种RNA结合蛋白与单个信使RNA的结合；

2) 此外，研究对哺乳动物Pumilio蛋白PUM1和PUM2的正交RNA分子记录结果显示，PUM1与PUM2竞争细胞中的一个子集位点，并鉴定了由结合位点远端的同种型变化驱动的转录物同种型特异性RNA-蛋白质相互作用，基因编码的RNA脱氨酶rABE能够单分子鉴定具有细胞类型特异性的RNA-蛋白质相互作用。

参考资料：

Lin, Y., Kwok, S., Hein, A.E. et al. RNA molecular recording with an engineered RNA deaminase. Nat Methods (2023).

10.1038/s41592-023-02046-z

https://doi.org/10.1038/s41592-023-02046-z