Nature Chem:通过DNA编码的动态分子库发现蛋白模板配体
纳米技术 纳米 2024-02-07

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DNA编码化合物库(DELs)已成为药物发现的强大技术平台。双药效基团DEL在DNA双链体的末端具有两组小分子,能够识别针对生物靶标的协同结合物,双药效基团目前成功的应用于基于DNA片段进行配体分子的发现,以及应用于对现有配体提高亲和力。然而,双药效团DEL识别出需要随后连接以获得完整配体的单独粘合剂,这通常是具有挑战性的。有鉴于此,香港大学李笑宇孙红哲中国人民解放军海军军医大学曹岩报道一种蛋白质模板DEL选择方法,该方法可以从DNA编码的动态文库(DEDL)中鉴定完整的配体/抑制剂结构,同时不需要进行片段连接。

本文要点:

(1)

这项研究方法基于动态DNA杂交和靶模板原位配体合成,通过结合编码文库中的连接体结构,用于靶蛋白采样。

(2)

为了证明该方法的性能,制备了435万和300万个具有不同文库结构的成员DEDL,并且实现了四种治疗功能靶蛋白的命中选择。

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参考文献

Zhou, Y., Shen, W., Gao, Y. et al. Protein-templated ligand discovery via the selection of DNA-encoded dynamic libraries. Nat. Chem. (2024)

DOI: 10.1038/s41557-024-01442-y

https://www.nature.com/articles/s41557-024-01442-y

 


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