Nature Chem:活细胞的基因编辑色氨酸
纳米技术 纳米 2024-02-28

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色氨酸(Trp, Tryptophan)通过分子的π化学键结构和吲哚N-H官能团起到调节蛋白质结构、相互作用和功能方面的关键作用。通过发展一种具有普适性的阻断和引发Trp相互作用的方法能够在体内对各种含有Trp的蛋白质进行功能操作,但如何发展这种控制Trp相互作用的方法仍然具有非常大的挑战。

有鉴于此,北京大学陈鹏樊新元、浙江大学林世贤报道开发了一种基因编码的N1-乙烯基-结构Trp,能够通过优化Diels–Alder反应电子需求的反向,从而实现快速和进行生物正交进行脱笼因此能够特异性的将活细胞感兴趣的蛋白质的Trp位点激活

本文要点

(1)

这种基因编码的笼状色氨酸(Trp-CAGE)策略具有的化学激活作用能够精确的激活感兴趣的Trp位点,这说明分子相互作用的重要作用。作者说明Trp-CAGE能够作为翻译起始物和翻译后修饰读取器用于各种蛋白质家族(比如过氧化氢酶过氧化物酶和激酶),并且能够以时间控制的方式调节表观遗传信号。

(2)

通过与计算机辅助预测进行结合,这个策略能够对天然细胞环境中28000多种蛋白质的Trp生物正交提供帮助。

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参考文献

Zhu, Y., Ding, W., Chen, Y. et al. Genetically encoded bioorthogonal tryptophan decaging in living cells. Nat. Chem. (2024)

DOI: 10.1038/s41557-024-01463-7

https://www.nature.com/articles/s41557-024-01463-7

 


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