基因编码的发光RNA适配体已成为观察和跟踪活细胞中RNA的有效工具。但是目前可以在远红外和近红外(NIR)区域中进行发光的适配体还很少。海德堡大学Murat Sunbul团队和Andres Jäschke团队合作开发了一种结合了硅罗丹明(SiRs)的发光RNA适配体。实验在体外利用测序、生物信息学分析和突变研究等手段选择了一种50个核苷酸的适配体，该适配体与SiRs具有纳米级亲和力并会形成SiRA。除了硅罗丹明之外, SiRA还可与其他结构如碳罗丹明结合，使其成为可在远红外区使用的工具。光物理特性研究表明，SiRA具有显著的抗光漂白性能，是目前已知的最亮的远红外适配体材料，其荧光量子产率为0.98，消光系数为86,000 M^-1cm^-1。实验利用该SiRA系统可以在活细胞成像实验中观察到细菌RNA的表达，并可以实现基于适配体的、荧光标记的mRNA在活细胞中的受激发发射损耗(STED)超分辨成像。

Regina Wirth, Murat Sunbul, Andres Jäschke. et al. SiRA – A Silicon Rhodamine-Binding Aptamer for Live-Cell SuperResolution RNA Imaging.

Journal of the American Chemical Society, 2019.

DOI: 10.1021/jacs.9b02697

https://pubs.acs.org.ccindex.cn/doi/10.1021/jacs.9b02697